О кафедре общей экологии и гидробиологии
История кафедры гидробиологии (в протоколах, документах и воспоминаниях). Под ред. проф. В.Д. Федорова. 2003. 144с.
Кафедре гидробиологии Московского университета 90 лет: прошлое и настоящее. 2014. 166 с. 
80 лет кафедре гидробиологии. Под ред. проф. В.Д. Федорова. 2004. 262с.
Программы спецкурсов. Гидробиология. Под ред. проф. В.Д. Федорова. М.: Ойкос, 2002. 136с.
Общая экология и гидробиология
Бурковский И.В., 2006. Морская биогеоценология. Организация сообществ и экосистем. 285с.
Зернов А.С., 1934. Общая гидробиология. 504с.
Зернов А.С., 1948. Общая гидробиология. 588с.
Федоров В.Д., Гильманов Т.Г., 1980. Экология. 464с.
Федоров В.Д., Капков В.И., 2000. Руководство по гидробиологическому контролю качества вод. 120с.
Практическая гидробиология. Пресноводные экосистемы. Под ред. В.Д. Федорова и В.И. Капкова. 2006. 367с.
Телитченко М.М., Остроумов С.А., 1990. Введение в проблемы экологии. 288с.
Максимов В.Н., 1980. Многофакторный эксперимент в биологии. 279с.
Хромов В.М., Семин В.А., 1975. Методы определения первичной продукции и деструкции в водоемах. 123с.
Чертопруд М.В., 2005. Гидробиологические экскурсии в Подмосковье. 72 с.
Яшнов В.А., 1969. Практикум по гидробиологии. 428 с.
Экология сообществ бентоса
Бурковский И.В., 1984. Экология свободноживущих инфузорий. 208с.
Жирков И.А., 2010. Жизнь на дне. Био-география и био-экология бентоса. 444с.
Садчиков А.П., Кудряшов М.А. Гидроботаника: прибрежно-водная растительность. Учебное пособие для вузов. 2005. 240с.
Экология фитопланктона
Ильяш Л.В., Житина Л.С., Федоров В.Д., 2003. Фитопланктон Белого моря. 168с.
Федоров В.Д., 1979. О методах изучения фитопланктона и его активности. 168с.
Садчиков А.П., 2003. Методы изучения пресноводного фитопланктона.
Токсикология и экологическая физиология
Филенко О.Ф., 1988. Водная токсикология. 154с.
Дмитриева А.Г., Кожанова О.Н., Дронина Н.Л., 2002. Физиология растительных организмов и роль металлов. 160с.
Скадовский С.Н., 1955. Экологическая физиология водных организмов. 338с.
Строганов Н.С., 1962. Экологическая физиология рыб. 444с.
Скадовский С.Н., 1928. Применение методов физической химии к изучению биологии пресных вод. 561с.
Ипатова В.И., 2005. Адаптация водных растений к стрессовым абиотическим факторам среды.
Кураков А.В., Ильинский В.В., Котелевцев С.В., Садчиков А.П., 2006. Биоиндикация и реабилитация экосистем при нефтяных загрязнениях.
Котелевцев С.В., Нагдалиев Ф.Ф., Садчиков А.П., 2011. Биотестирование и биоиндикация при экологическом анализе окружающей среды. М.: Альтекс. 174 с.
Систематика и определители
Жирков И.А., 1989. Донная фауна морей СССР. Полихеты. 140с.
Жирков И.А., 2001. Полихеты Северного Ледовитого Океана. 631с.
Корнев П.Н., Чертопруд Е.С., 2008. Веслоногие ракообразные отряда Harpacticoida Белого моря: морфология, систематика, экология. М.: КМК. 379с.
Кузнецов Е.А., 2003. Грибные и грибоподобные организмы морских, солоноватоводных и пресноводных водоемов. 122с.
Определитель фауны и флоры северных морей СССР. Под ред. Н.С. Гаевской. 1949. 740с.